Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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