Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NFIXQ14938 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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