Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms