Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IHHQ14623 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IHHQ14623 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IHHQ14623 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IHHQ14623 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IHHQ14623 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IHHQ14623 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IHHQ14623 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IHHQ14623 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IHHQ14623 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IHHQ14623 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IHHQ14623 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IHHQ14623 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IHHQ14623 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IHHQ14623 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IHHQ14623 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IHHQ14623 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IHHQ14623 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IHHQ14623 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms