Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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FAM53BQ14153 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM53BQ14153 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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