Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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