Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
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