Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEUROD1Q13562 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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