Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCIRG1Q13488 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
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TCIRG1Q13488 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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