Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TOP3AQ13472 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TOP3AQ13472 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TOP3AQ13472 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TOP3AQ13472 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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