Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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FOXE3Q13461 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXE3Q13461 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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