Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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ITGB3BPQ13352 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
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