Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 ETF1-202ENST00000499810 3874 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.214e-6■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 ETF1-201ENST00000360541 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.414e-6■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.735e-17■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 PTGES2-212ENST00000496594 2103 ntTSL 524.67■■□□□ 1.549e-12■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.59e-12■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.219e-12■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 PTGES2-211ENST00000493205 1514 ntTSL 522.48■■□□□ 1.199e-12■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.959e-12■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 PTGES2-205ENST00000476655 1063 ntTSL 319.64■□□□□ 0.739e-12■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 PSMB3-210ENST00000618159 562 ntTSL 211.44□□□□□ -0.588e-15■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 SEC61G-205ENST00000460484 1227 ntTSL 1 (best)11□□□□□ -0.653e-26■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 SEC61G-207ENST00000480303 661 ntTSL 1 (best)10.59□□□□□ -0.713e-26■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 SEC61G-206ENST00000461536 437 ntTSL 25.02□□□□□ -1.613e-26■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.086e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.366e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.266e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.386e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 SND1-212ENST00000485871 597 ntTSL 312.95□□□□□ -0.344e-8■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 RPS27A-210ENST00000495843 1159 ntTSL 59.15□□□□□ -0.944e-44■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.083e-9■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 HDAC1-206ENST00000476391 2409 ntTSL 1 (best)14.99□□□□□ -0.013e-9■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 CTPS1-202ENST00000372621 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.171e-7■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.022e-9■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 FBL-208ENST00000598417 581 ntTSL 522.82■■□□□ 1.245e-12■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.231e-6■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 UBXN1-217ENST00000534176 943 ntTSL 318.67■□□□□ 0.583e-9■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.661e-15■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 RHOC-214ENST00000478447 420 ntTSL 215□□□□□ -0.014e-12■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.51e-6■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.261e-6■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 UBXN1-204ENST00000524762 763 ntTSL 322.78■■□□□ 1.243e-9■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 UBXN1-208ENST00000527421 1085 ntTSL 522.41■■□□□ 1.183e-9■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 UBXN1-207ENST00000526919 759 ntTSL 319.98■□□□□ 0.793e-9■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.461e-6■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.291e-6■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 TAF11-202ENST00000420584 1465 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.031e-6■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 EIF3L-212ENST00000477256 1708 ntTSL 58.15□□□□□ -1.117e-11■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.851e-8■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.011e-8■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 ARPC4-TTLL3-203ENST00000424442 903 ntTSL 513.71□□□□□ -0.211e-8■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 ARPC4-TTLL3-202ENST00000418163 551 ntTSL 413.31□□□□□ -0.281e-8■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 ARPC4-TTLL3-204ENST00000453882 499 ntTSL 48.74□□□□□ -1.011e-8■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.415e-11■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 FBL-204ENST00000594443 805 ntTSL 315.71■□□□□ 0.115e-11■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.663e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.123e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.622e-28■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 STK25-224ENST00000472181 464 ntTSL 324.46■■□□□ 1.513e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.443e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.443e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.433e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.373e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.353e-10■■□□□ 13.8
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PABPC4Q13310 SELENOO-202ENST00000492092 1626 ntTSL 1 (best)22.68■■□□□ 1.223e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.23e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 GAK-203ENST00000502799 2281 ntTSL 222.54■■□□□ 1.23e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.13e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.063e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.917e-7■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 STK25-230ENST00000494699 797 ntTSL 220.57■□□□□ 0.883e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.883e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.833e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.833e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.833e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 GAK-205ENST00000504668 929 ntTSL 319.92■□□□□ 0.783e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 GAK-217ENST00000511980 1768 ntTSL 519.42■□□□□ 0.73e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 STK25-228ENST00000487962 2024 ntTSL 219.24■□□□□ 0.673e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.673e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.652e-6■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 GRAP2-204ENST00000460449 442 ntTSL 218.26■□□□□ 0.513e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.433e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 EIF2B5-212ENST00000491144 3038 ntTSL 217.3■□□□□ 0.363e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.347e-11■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.343e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.283e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.223e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.213e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.213e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 GAK-211ENST00000509566 3126 ntTSL 216.28■□□□□ 0.23e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.193e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.183e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.093e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 EIF2B5-209ENST00000481054 3460 ntTSL 1 (best)15.43■□□□□ 0.063e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 POLR2H-207ENST00000455712 823 ntTSL 315.24■□□□□ 0.036e-11■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.013e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 RPUSD4-208ENST00000533628 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.023e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 MPI-208ENST00000563786 1707 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.053e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 IMP4-205ENST00000452955 923 ntTSL 314.65□□□□□ -0.067e-7■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 GAK-216ENST00000511345 3567 ntTSL 214.62□□□□□ -0.073e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 PRICKLE3-205ENST00000540849 2246 ntTSL 214.56□□□□□ -0.083e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.13e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 RPUSD4-203ENST00000526942 1791 ntTSL 514.32□□□□□ -0.123e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 EIF2B5-204ENST00000465218 1310 ntTSL 513.88□□□□□ -0.193e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 GAK-221ENST00000515868 3903 ntTSL 213.24□□□□□ -0.293e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 POLR2H-212ENST00000489043 433 ntTSL 212.51□□□□□ -0.416e-11■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 DDOST-204ENST00000475210 328 ntTSL 212.44□□□□□ -0.423e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 NDRG2-212ENST00000403829 1500 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.583e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 TP53BP2-209ENST00000483398 1841 ntTSL 29.63□□□□□ -0.873e-10■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 GGH-203ENST00000518466 696 ntTSL 37.68□□□□□ -1.183e-10■■□□□ 13.8
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