Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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