Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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BPTFQ12830 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BPTFQ12830 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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BPTFQ12830 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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