Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP4Q09028 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms