Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms