Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCK1Q08629 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms