Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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TFF3Q07654 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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TFF3Q07654 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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TFF3Q07654 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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