Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms