Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLOD1Q02809 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms