Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms