Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms