Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK16Q00536 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms