Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms