Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COG7P83436 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COG7P83436 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COG7P83436 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COG7P83436 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COG7P83436 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COG7P83436 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COG7P83436 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COG7P83436 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COG7P83436 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COG7P83436 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COG7P83436 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COG7P83436 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COG7P83436 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COG7P83436 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COG7P83436 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COG7P83436 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COG7P83436 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COG7P83436 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COG7P83436 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COG7P83436 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COG7P83436 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COG7P83436 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COG7P83436 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COG7P83436 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COG7P83436 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COG7P83436 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COG7P83436 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COG7P83436 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COG7P83436 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COG7P83436 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COG7P83436 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COG7P83436 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COG7P83436 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COG7P83436 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COG7P83436 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COG7P83436 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG7P83436 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COG7P83436 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms