Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAE1P78406 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAE1P78406 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAE1P78406 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAE1P78406 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAE1P78406 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAE1P78406 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAE1P78406 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAE1P78406 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAE1P78406 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAE1P78406 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms