Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GEMP55040 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GEMP55040 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GEMP55040 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GEMP55040 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GEMP55040 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GEMP55040 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GEMP55040 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GEMP55040 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GEMP55040 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GEMP55040 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GEMP55040 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEMP55040 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEMP55040 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms