Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms