Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A1P52655 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A1P52655 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A1P52655 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A1P52655 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A1P52655 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A1P52655 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A1P52655 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A1P52655 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A1P52655 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A1P52655 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A1P52655 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A1P52655 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A1P52655 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A1P52655 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A1P52655 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A1P52655 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A1P52655 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A1P52655 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms