Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX2P50458 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX2P50458 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX2P50458 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX2P50458 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX2P50458 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX2P50458 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX2P50458 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX2P50458 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX2P50458 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX2P50458 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX2P50458 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHX2P50458 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHX2P50458 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHX2P50458 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHX2P50458 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHX2P50458 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms