Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms