Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms