Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms