Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ME1P48163 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ME1P48163 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms