Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRATP43155 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRATP43155 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRATP43155 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRATP43155 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRATP43155 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRATP43155 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRATP43155 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRATP43155 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRATP43155 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRATP43155 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRATP43155 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CRATP43155 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRATP43155 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRATP43155 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRATP43155 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms