Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms