Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTR1BP42025 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms