Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZEB1P37275 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms