Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms