Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms