Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TSPOP30536 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms