Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms