Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSSP25774 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSSP25774 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTSSP25774 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms