Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTAFRP25105 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTAFRP25105 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTAFRP25105 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTAFRP25105 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTAFRP25105 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTAFRP25105 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms