Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

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Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP24386 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP24386 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP24386 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP24386 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP24386 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP24386 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP24386 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP24386 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP24386 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP24386 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP24386 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP24386 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP24386 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP24386 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP24386 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP24386 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP24386 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP24386 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP24386 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP24386 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP24386 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP24386 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP24386 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP24386 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP24386 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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