Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPREP23469 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPREP23469 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPREP23469 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPREP23469 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPREP23469 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPREP23469 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPREP23469 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPREP23469 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPREP23469 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPREP23469 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPREP23469 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPREP23469 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPREP23469 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPREP23469 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPREP23469 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPREP23469 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPREP23469 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPREP23469 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPREP23469 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPREP23469 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPREP23469 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
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