Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ME2P23368 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ME2P23368 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ME2P23368 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ME2P23368 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ME2P23368 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ME2P23368 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ME2P23368 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ME2P23368 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ME2P23368 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ME2P23368 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ME2P23368 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ME2P23368 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ME2P23368 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ME2P23368 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ME2P23368 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ME2P23368 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ME2P23368 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ME2P23368 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms