Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms