Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GP1BBP13224 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms